ゲノム解析 変異のvalidationー論文には記載されない影の努力ー
論文には載らない（一般的にも書いていない）部分である変異のvalidation
ゲノム解析 ゲノム解析 HaplotypeCallerとUnifiedGenotyper
GATK3のHaplotypeCallerで検出できるけど、UnifiedGenotyperでは検出できない変異があった
ゲノム解析 初めてのRNA-seq解析 by Rhelixa RNA-seq解析パイプライン
初めてのRNA-seq解析の記録を記載してます。使ったのは遺伝研スパコンに入っているRhelixa RNA-seq解析パイプラインです。
ゲノム解析 interval のための bed file 作成まとめ
UCSC Genome Browserを使ったinterval のための bed file 作成まとめ
ゲノム解析 EBI VCF validator を使ってみた – その２-
EBI VCF validator にStrelka2のデモファイルを通す
ゲノム解析 EBI VCF validator を使ってみた
EBI VCF validator を使ってみた
Web ディレクトリを解凍するとファイルになる
ディレクトリを解凍したらファイルになってしまった
ゲノム解析 sratoolkitを使ったデータダウンロード
久しぶりにsratoolを使ったのでメモ
srattoolkit.2.9.6-1-ubuntu64/bin/prefetch SRR642637
でダウンロードできる。
ダウンロードしたファイルは、
ncbi/pu...
Web Amon2を使ってみた-その3
Amon2を使ってみた-その3
Web Amon2を使ってみた-その２
Amon2を使ってみたの続き。