sratoolkitを使ったデータダウンロード

久しぶりにsratoolを使ったのでメモ

srattoolkit.2.9.6-1-ubuntu64/bin/prefetch SRR642637

でダウンロードできる。

ダウンロードしたファイルは、

ncbi/public/sra

に入ってる。

これを fastq-dump とかで fastq にして使用する。